El Dr. Varun Malhotra completó su educación médica básica en el Topiwala National Medical College y el BYL Nair Hospital, Mumbai, y obtuvo una maestría en oftalmología en el JJM Medical College, Davanagere, afiliado a la Rajiv Gandhi University of Health Sciences, Bangalore, seguido de una beca en córnea, segmento anterior y cirugía refractiva en la prestigiosa Sankara Nethralaya, Chennai. Terminó la beca Sir Ratan Tata en cirugías de cataratas por microincisión en Sankara Nethralaya y fue becario de Zeiss-Ophthalmic Diagnostics en el LV Prasad- Eye Institute, Hyderabad. También se formó con el Dr. Rupal Shahin en cirugía refractiva, quien es una autoridad en el tema. La experiencia previa del Dr. Varun incluye un período como consultor en el Anand Eye Institute, Hyderabad y consultor en el Pushpagiri Eye Institute, Secunderabad.