Mustafa Güden nació en 1965 en Kayseri, Turquía. Después de graduarse en la escuela secundaria Kadıköy Anadolu, completó su educación médica en la Facultad de Medicina de Çapa de la Universidad de Estambul en 1989. Obtuvo su especialización en cirugía cardiovascular en el Instituto de Cardiología de la Universidad de Estambul y trabajó durante 10 años en el Hospital Florence Nightingale de Şişli. Durante este tiempo, también completó una capacitación a corto plazo en la Clínica OLV en Bélgica.
En 2004, el Dr. Güden se convirtió en profesor asociado y en 2013 fue ascendido a profesor titular. De 2016 a 2022, se desempeñó como cirujano cardiovascular en el Hospital Universitario Medipol Mega. En 2023, abrió su consultorio privado en Kadıköy, Estambul.
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